DNA基因分型-qPCR TaqMan法
SNP/ 單核苷酸多態性分析
說明
SNP(Single Nucleotide Polymorphism)，即單核苷酸多態性，是由於單個核苷酸改變而導致的核酸序列多態。一般來說，一個 SNP 位點只有兩種等位基因，因此又叫雙等位基因。SNP 在人類基因組中的發生頻率比較高，大約平均每 1000 個鹼基中就有一個多態位點。有些 SNP 位點還會影響基因的功能，導致生物性狀改變甚至致病。單核苷酸多態性是研究人類家族和動植物品系遺傳變異的重要依據，因此被廣泛用於群體遺傳學研究 (如生物的起源、進化及遷移等方面) 和疾病相關基因的研究，在藥物基因組學、診斷學和生物醫學研究中起重要作用。
TaqMan法
原理
每個SNP位點設計一對Taqman探針，分別標記不同的螢光。5 '末端帶有報告螢光基團, 3'端標有螢光淬滅基團，Taq聚合酶具有外切活性，從而將探針5 ’端連接的螢光分子從探針上切割下來，破壞兩螢光分子間的PRET，發出螢光。
TaqMan法
原理
每個SNP位點設計一對Taqman探針，分別標記不同的螢光。5 '末端帶有報告螢光基團, 3'端標有螢光淬滅基團，Taq聚合酶具有外切活性，從而將探針5 ’端連接的螢光分子從探針上切割下來，破壞兩螢光分子間的PRET，發出螢光。
報告內容
注意事項
* 所需樣品種類：細胞株，動物組織類，植物組織類等等。
* 樣品須為非感染性生物。
* 為了避免樣本RNA degradation，可採下列方式處理檢體:
1. 1份樣本體積與4份RNA Keeper Tissue Stabilizer 均質混合，可穩定保存於4度C一周內。
2. 血液樣本以3倍體積加入RBC Lysis Buffer。
可提供下列資料:
* SNP ID : 例如 rs12508358或者欲區別的DNA區段與變異點。
* 樣本物種 : 例如人類 , 雞 ,羊等 。
聯絡我們 , 我們將盡速為您服務 。
線上加入 LINE ID : @topgen
* 樣品須為非感染性生物。
* 為了避免樣本RNA degradation，可採下列方式處理檢體:
1. 1份樣本體積與4份RNA Keeper Tissue Stabilizer 均質混合，可穩定保存於4度C一周內。
2. 血液樣本以3倍體積加入RBC Lysis Buffer。
可提供下列資料:
* SNP ID : 例如 rs12508358或者欲區別的DNA區段與變異點。
* 樣本物種 : 例如人類 , 雞 ,羊等 。
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* 庫存清單
| SNP ID | 基因 | 相關疾病 |
| rs2231137 | ABCG2 | Breast Cancer (乳癌) / Gouty arthritis (痛風性關節炎) / Uric Acid(尿酸) |
| rs2231142 | ABCG2 | Breast Cancer (乳癌) / Gouty arthritis (痛風性關節炎) / Uric Acid(尿酸) |
| rs34783571 | ABCG2 | Gouty arthritis (痛風性關節炎) / Uric Acid(尿酸) |
| rs10963755 | ADAMTSL1 | Breast Cancer (乳癌) |
| rs715212 | ADAMTSL1 | Breast Cancer (乳癌) |
| rs671 | ALDH2 | Alcohol flush (酒精性臉紅) |
| rs5082 | APOA2 | Coronary artery (冠狀動脈疾病) / fat metabolisim (脂質代謝) |
| rs2072309 | BSG | Cerebral malaria (腦性瘧疾) |
| rs28915400 | BSG | Ischemic stroke (缺血性中風) |
| rs6758 | BSG | Ischemic stroke (缺血性中風) |
| rs1001179 | CAT | Visual acuity (視覺敏銳度) |
| rs10946398 | CDKAL1 | Diabetes mellitus type 2 (第二型糖尿病) |
| rs10811661 | CDKN2A | Dyslipidemia (血脂異常) |
| rs12302097 | CHST11 /TXNRD1 |
Breast Cancer (乳癌) |
| rs12508358 | CLNK | Asthmatics (哮喘) |
| rs2020917 | COMT | Breast Cancer (乳癌) |
| rs1130864 | CRP | Ischemic stroke (缺血性中風) |
| rs1205 | CRP | Kidney disease (腎臟病) / Periodontitis (牙周病) |
| rs1800947 | CRP | Colorectal cancer (結直腸癌) |
| rs2794520 | CRP | Kidney disease (腎臟病) / Periodontitis (牙周病) |
| rs2304053 | FAT2 | Asthmatics (哮喘) / Obesity (肥胖) |
| rs8050136 | FTO | Diabetes mellitus type 2 (第二型糖尿病) |
| rs707025 | GALNT13 | Asthmatics (哮喘) |
| rs780094 | GCKR | Gouty arthritis (痛風性關節炎) / Uric Acid(尿酸) |
| rs1111875 | HHEX | Diabetes mellitus type 2 (第二型糖尿病) |
| rs4402960 | IGF2BP2 | Diabetes mellitus type 2 (第二型糖尿病) |
| rs2721 | INSIG1 | hypertriglyceridemia (高甘油三酯血症) |
| rs1801278 | IRS1 | Metabolic syndrome (代謝症候群) |
| rs2943641 | IRS1 | Diabetes mellitus type 2 (第二型糖尿病) |
| rs838147 | IZUMO1 | |
| rs410155 | MT3/MT4 | Breast Cancer (乳癌) |
| rs1801131 | MTHFR | Colorectal cancer (結直腸癌) |
| rs1801133 | MTHFR | Colorectal cancer (結直腸癌) / Parkinson's disease (帕金森氏症) / Folate metabolism (葉酸代謝) |
| rs1801394 | MTRR | Colorectal cancer (結直腸癌) /Gastric cacner (胃癌) / Folate metabolism (葉酸代謝) |
| rs10472110 | PDE4D | |
| rs1801282 | PPARG | Metabolic syndrome (代謝症候群) |
| rs215274 | SEMA3E | Asthmatics (哮喘) / Obesity (肥胖) |
| rs1183201 | SLC17A1 | Gouty arthritis (痛風性關節炎) / Uric Acid (尿酸) |
| rs622342 | SLC22A1 | Diabetes mellitus type 2 (第二型糖尿病) |
| rs475688 | SLC22A12 | Gouty arthritis (痛風性關節炎) / Uric Acid(尿酸) |
| rs505802 | SLC22A12 | Gouty arthritis (痛風性關節炎) / Uric Acid(尿酸) |
| rs1014290 | SLC2A9 | Diabetes mellitus type 2 (第二型糖尿病) |
| rs16890979 | SLC2A9 | Gouty arthritis (痛風性關節炎)/Uric Acid(尿酸) |
| rs3733589 | SLC2A9 | Gouty arthritis (痛風性關節炎) / Uric Acid(尿酸) |
| rs3733591 | SLC2A9 | Diabetes mellitus type 2 (第二型糖尿病) / Gouty arthritis (痛風性關節炎) / Uric Acid(尿酸) |
| rs6855911 | SLC2A9 | Gouty arthritis (痛風性關節炎) / Uric Acid(尿酸) |
| rs737267 | SLC2A9 | Gouty arthritis (痛風性關節炎) / Uric Acid(尿酸) |
| rs7442295 | SLC2A9 | Gouty arthritis (痛風性關節炎)/Uric Acid(尿酸) |
| rs11196205 | TCF7L2 | Diabetes mellitus type 2 (第二型糖尿病) |
| rs12255372 | TCF7L2 | Diabetes mellitus type 2 (第二型糖尿病) |
| rs7895340 | TCF7L2 | Diabetes mellitus type 2 (第二型糖尿病) |
| rs7903146 | TCF7L2 | Diabetes mellitus type 2 (第二型糖尿病) |
| rs7901695 | TCF7L2 | Diabetes mellitus type 2 (第二型糖尿病) |
| rs1544410 | VDR | Breast Cancer (乳癌) |
| rs2228570 | VDR | Kidney disease (腎臟病) |
| rs731236 | VDR | Kidney disease (腎臟病) |
| rs7975232 | VDR | Kidney disease (腎臟病) |
| rs1050450 | GPx-1 | 前列腺癌 |
| rs10509681 | CYP2C8 | |
| rs10877012 | CYP27B1 | Colorectal cancer (結直腸癌) |
| rs11212617 | ATM | ----------- |
| rs113488022 | BRAF | ----------- |
| rs113781054 | POLRMT | ----------- |
| rs11473 | BSG | ----------- |
| rs11574129 | VDR | |
| rs1205 | CRP4 | |
| rs121913364 | BRAF | |
| rs12589059 | TRIP11 | |
| rs139994842 | NOTCH1 | |
| rs142745636 | SEC31A | |
| rs148958230 | SEC31A | |
| rs2041192 | ||
| rs2070833 | BRCA1 | |
| rs2072307 | BSG | |
| rs2072308 | ||
| rs223818 | CCL22 | |
| rs2283725 | ADHD | |
| rs2333227 | MPO | |
| rs25531 | SLC6A4 | |
| rs25532 | 5-HTTLPR | |
| rs2822641 | HSPA13 | |
| rs28647489 | ||
| rs3791679 | EFEMP1 | |
| rs387907272 | MyD88 | |
| rs4149056 | SLCO1B1 | |
| rs4359426 | CCL22 | |
| rs4818 | COMT | |
| rs4880 | SOD2 | |
| rs4919862 | CD147 | |
| rs5219 | KCNJ11 | |
| rs550675 | COL9A1 | |
| rs5953210 | MAOA | |
| rs61669219 | POLR1B | |
| rs72705395 | TRIP11 | |
| rs7319493 | TMCO3 | |
| rs739565 | ||
| rs739837 | VDR | Diabetes mellitus type 2 (第二型糖尿病) |
| rs748467490 | ||
| rs7627468 | CASR | Kidney disease (腎臟病) |
| rs8050136 | ||
| rs819267 | PGC1 | |
| rs8259 | BSG |